Здравствуйте! Да, вы правы, вам нужно подавать в суд исковое заявление о прекращении права пользования жилым помещением и снятии с регистрационного учета своей сестры. Судя по описанной вами ситуации никаких проблем возникнуть не должно, и решение по делу будет в вашу пользу. Не забудьте...